文/《 身體不健康，腸漏先知道》何兆芬
免疫系統分為先天(innate)與後天(adaptive)，而我們的免疫系統需要「分辨」，才會知道誰是該殲滅殺死的病原與毒素，誰又是可以幫助身體的幫手。而腸道菌駐在腸黏膜上，它可以刺激身體的先天免疫力，且對於刺激黏膜的強壯也很有助益，它們會產生乙酸、丙酸、丁酸的代謝物，其中丁酸是腸道上皮細胞的能量來源，這些細菌的代謝物可提供人體百分之十的能量來源。簡單來說，好菌的發酵作用有益於健康，壞菌的腐敗作用會使人生病。
腸道菌分成三種角色
對人類而言，腸道菌可分成以下三種：
①好菌：又稱益菌、共生菌，約佔百分之十∼二十。好菌一般指乳酸桿菌、雙岐桿菌等乳酸菌群，會發酵乳醣、葡萄糖，生成乳酸、醋酸(乙酸)和丁酸等，使腸道處於微酸狀態。
②壞菌：又稱害菌、致病菌，佔百分之二十。指困難腸梭菌、病原性大腸菌、葡萄球菌、赤痢菌、傷寒菌等。它們會將小腸中沒有被完全消化吸收的脂肪和蛋白質做腐敗反應，產生胺基酸、氨、硫化氫、組織胺和吲等。當攝取過量脂肪時，體內膽汁就會被分泌，糞便變成鹼性，顏色也會呈現膽汁的顏色，變成深褐色或墨綠色。
③中性菌：又稱伺機菌與條件致病菌，約佔百分之六十∼七十。中性菌是不好不壞，但會根據腸道環境而改變，伺機變好或變壞。
孩子的腸道菌最先來自母親
以人類的成長過程來看，孩子一出生後，早期進駐腸道的是腸桿菌屬(屬於變形菌門)，和雙歧桿菌屬(屬於放線菌門)，這些先驅者會影響宿主基因的表現，以產生適合它們居住的環境，阻止其他細菌的生長。
剖腹產的新生兒，其腸道內的菌種會出現媽媽皮膚上的菌，如金黃色葡萄球菌、丙酸桿菌(Propionibacterium spp)和棒狀桿菌(Corynebacterium)。而自然產的寶寶腸道內則是媽媽陰道裡的菌種，如乳酸菌、普雷沃菌屬(Prevotella)、斯尼斯菌(Sneathia)。這些烙印的菌種會一直存在孩子的體內，直到長大成人。所以，腸道菌最先來自母親。我常告訴病人，很少有女性醫師選擇剖腹產的原因在此。
2010年有一篇研究指出，研究者分析了歐洲小孩與非洲小孩的腸道菌叢後，發現歐洲小孩的厚壁菌門較多，擬桿菌門較少；非洲小孩則是相反，擬桿菌門多，厚壁菌門少。由孩子的體型來觀察，歐洲的孩子普遍比非洲小孩胖，這結果吻合一項小鼠實驗：腸道內厚壁菌門(乳酸菌)多的小鼠比較胖。以上研究說明了生產方式、飲食文化、年齡、生活方式會改變人們腸內菌種，會影響腸道的菌叢組合，這些變因影響了個人日後罹患代謝等疾病的機率。
